I have just noticed an entry in the german moo2 wikipedia:Modem and IPX support improved for multiplayer
A small translation:Eine weitere Möglichkeit Master of Orion 2 über das Internet zu spielen, bietet der DOS-Emulator DOSBox. Hierfür muss ein Spieler vor Spielstart durch Eingabe des Befehls "ipxnet startserver" als Server agieren. Clients verbinden sich zu diesem Rechner mit dem Befehl "ipxnet connect SERVER-IP-ADRESSE". Im Spiel wird dann der normale Multiplayer-Modus verwendet (IPX). IPX muss in der DOSBox-Konfiguration einmalig aktiviert werden.
A further option to play moo2 online is provided by dosbox. The server has to use the command "ipxnet startserver". Other players can connect with the command "ipxnet connect SERVER-IP-ADDRESS". Normal multiplayer inside moo2 (i guess they mean "network"). IPX has to be activated inside the dosbox configuration.
EDIT:
See also the updated DOSbox guide in my signature.